SOURCE

var arr = [4,2,[1,2,3],[5,[7,9,[9,9]]]]
var recurise = true
var result = []

function array_unique(res,arr,recurise = true){
  for(var i = 0; i < arr.length; i++){
    if(arr[i].length > 0) {
      if(recurise) array_unique(res,arr[i],recurise)
    } else {
      if(res.indexOf(arr[i]) === -1){
        res.push(arr[i])
      }
    }
  }
}

array_unique(result, arr)
console.log(result)